199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03031 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  70.82 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  69.53 
 
 		 246 aa  291  5e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02931  cobalamin-5-phosphate synthase  68.24 
 
 		 170 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.93 
 
 		 268 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.05 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1636  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.74 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.33 
 
 		 193 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.75 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  32.3 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.33 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  34.97 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.97 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.26 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  30.57 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  29.44 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  30.26 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  31.02 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.18 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.51 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.34 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.32 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  27.65 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  27.65 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.85 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  27.06 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  27.06 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  27.06 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  27.06 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  27.4 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.14 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.9 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.96 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.97 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  25 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  26.73 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  27.8 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  29.12 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  38.14 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  25.64 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  25.64 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  25.64 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  25.64 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.22 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.35 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  30.41 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.98 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.21 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.79 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  22.69 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.74 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  27.27 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.84 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  23.5 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  22.27 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.34 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.92 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  27.27 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.05 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  30.15 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.19 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.86 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.07 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  21.46 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.91 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.05 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.3 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.3 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  28.17 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  28.87 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  25.78 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.78 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  27.59 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.39 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  23.73 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  54.35 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  23.98 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.09 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  26.64 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  29.7 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.75 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  27.7 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  27.7 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  27.7 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.65 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  27.23 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1566  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.13 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212563  normal  0.0205938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  29.17 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.44 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.63 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.93 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.93 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  27.69 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  24.28 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  24.28 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.32 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.51 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>