249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0485 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 248 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  36.32 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  34.84 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.68 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  33.62 
 
 		 250 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.48 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.2 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.2 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.48 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.44 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.72 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  37.19 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.04 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  37.04 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.48 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  37.04 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.52 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  36.78 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  36.78 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.48 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  36.78 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.3 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  36.86 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  30.61 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  35.68 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.6 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  36.25 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.44 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.84 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  35.27 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.08 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  36.25 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.99 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.02 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  36.13 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.22 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  34.58 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.58 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.27 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  33.9 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  35.83 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  35.51 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  35.51 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.47 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  35.1 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  35.83 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.62 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.79 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.66 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  34.85 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  34.23 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.62 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.93 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  33.76 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  33.76 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  33.76 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.48 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  33.76 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  33.76 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  33.76 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  33.76 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.6 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.49 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  35 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  30.92 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.21 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  32.24 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  32.64 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  34.91 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  31.05 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  33.61 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.47 
 
 		 250 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  34.02 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  34.57 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  28.95 
 
 		 262 aa  85.5  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  34.16 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  34.05 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.62 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.94 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  34.3 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  30.4 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>