198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2458 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  58.57 
 
 		 252 aa  281  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  57.6 
 
 		 255 aa  276  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  54.76 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  57.68 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  55.51 
 
 		 256 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  56.85 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  50 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.79 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  34.57 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.77 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.83 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.83 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.83 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.66 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.55 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.62 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.55 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.03 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.62 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  35.08 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  35.08 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  34.43 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.2 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.97 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  34.68 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.68 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.68 
 
 		 193 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.86 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1636  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.8 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.93 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.79 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.48 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  26.67 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.02 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.77 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  33.87 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.46 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.54 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.9 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.46 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.19 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.03 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.6 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  28.68 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.8 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.84 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  30.77 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.77 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.4 
 
 		 260 aa  72  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  28.51 
 
 		 258 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  31.08 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.95 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.67 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.1 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1340  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.92 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.46 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  31.97 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.58 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.38 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.8 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  27.52 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.48 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.71 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  32 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.62 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  27.08 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  30.29 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  28.29 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.39 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  27.55 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.06 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.86 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.09 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.52 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  29.73 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.54 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  31.2 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  27.31 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.95 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  27.38 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.02 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  29.01 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.44 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.58 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  27.42 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  27.62 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.08 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>