214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0089 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.06 
 
 
267 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.71 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  41.96 
 
 
256 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.31 
 
 
255 aa  201  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.14 
 
 
257 aa  198  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  41.96 
 
 
261 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  42.75 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.8 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  45.49 
 
 
260 aa  194  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  45.2 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  40.23 
 
 
250 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  43.53 
 
 
262 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  43.53 
 
 
262 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  43.53 
 
 
262 aa  188  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  41.7 
 
 
302 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  40.71 
 
 
295 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  39.69 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  39.3 
 
 
258 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  40.54 
 
 
258 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  37.88 
 
 
259 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  41.18 
 
 
262 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  39.69 
 
 
256 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  40.71 
 
 
258 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  40.39 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  40.39 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  40.39 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  40.39 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  39.06 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  41.7 
 
 
259 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  38.67 
 
 
250 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  38.67 
 
 
250 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  37.1 
 
 
258 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.31 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  37.89 
 
 
258 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  38.28 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  40.4 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  38.67 
 
 
259 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  39.11 
 
 
224 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.51 
 
 
264 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.43 
 
 
269 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.54 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  39.11 
 
 
224 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  39.15 
 
 
262 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.23 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.58 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  35 
 
 
276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  37.65 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.94 
 
 
258 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.69 
 
 
277 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.46 
 
 
282 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.68 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.69 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  35.97 
 
 
252 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.21 
 
 
278 aa  131  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.6 
 
 
270 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0657  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.58 
 
 
270 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00645782  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  35.97 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  35.97 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  35.97 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  35.97 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  35.97 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  35.97 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  35.97 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.25 
 
 
270 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.3 
 
 
247 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.3 
 
 
247 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.92 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  29.55 
 
 
247 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  29.17 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  29.17 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  29.17 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  29.17 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2567  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.33 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.66 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  32.69 
 
 
260 aa  112  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  34.62 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  28.46 
 
 
247 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  28.79 
 
 
247 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.38 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  28.06 
 
 
247 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  28.06 
 
 
247 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  28.06 
 
 
247 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.74 
 
 
258 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  28.34 
 
 
240 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  32.26 
 
 
262 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.79 
 
 
256 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.46 
 
 
290 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.08 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.84 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.41 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 
275 aa  99  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.17 
 
 
275 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.89 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  33.61 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.76 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.83 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.24 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.24 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.72 
 
 
248 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>