252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2176 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
251 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  59.49 
 
 
268 aa  261  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  57.56 
 
 
268 aa  248  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.85 
 
 
249 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.86 
 
 
249 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.3 
 
 
254 aa  135  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  37.35 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
253 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.48 
 
 
254 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.48 
 
 
254 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  37.13 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  37.13 
 
 
240 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  37.13 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.8 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  37.13 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  34.06 
 
 
248 aa  125  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.11 
 
 
248 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.73 
 
 
251 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  35.98 
 
 
247 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  35.98 
 
 
247 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
247 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.91 
 
 
242 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  36.29 
 
 
247 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  35.98 
 
 
247 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  35.98 
 
 
247 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  35.98 
 
 
247 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  35.98 
 
 
247 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  35.98 
 
 
247 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.06 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.07 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  35.77 
 
 
252 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  36.4 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  31.15 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  28.15 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.71 
 
 
246 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.54 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.8 
 
 
268 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.89 
 
 
251 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.29 
 
 
258 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.6 
 
 
248 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  34.21 
 
 
260 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 
255 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.29 
 
 
240 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.99 
 
 
275 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  34.21 
 
 
260 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.16 
 
 
240 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.56 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  36.73 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.78 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.78 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.37 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  28.69 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.9 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  36.8 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.1 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.49 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.8 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.38 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  34.5 
 
 
250 aa  89.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.7 
 
 
278 aa  89  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.44 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  30.2 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  33.6 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.67 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.74 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  35.42 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.67 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 
265 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.1 
 
 
252 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.77 
 
 
256 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  34.27 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  29.53 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.33 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.13 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.24 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  30.16 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  30.92 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
267 aa  82  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.38 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  29.61 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.39 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.03 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  32.41 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  28.23 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  27.67 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  44 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.74 
 
 
278 aa  79  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  31.23 
 
 
261 aa  79  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.88 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  31.82 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.65 
 
 
323 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.2 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  26.61 
 
 
295 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  34.21 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.42 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>