238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0939 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 278 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.26 
 
 		 275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.03 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.48 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.04 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.69 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.89 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.55 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  24.71 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.64 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  40 
 
 		 253 aa  89.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.44 
 
 		 237 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  30.42 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.35 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  29.26 
 
 		 258 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.15 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  37.06 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.15 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.62 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.41 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.16 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.15 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.53 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.53 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.53 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.53 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.15 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  30.04 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  34.98 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.86 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.89 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  26.12 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.78 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  35.26 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.3 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  29.39 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.8 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.92 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  27.17 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.38 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  32.67 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.62 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.6 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.99 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.27 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  29.09 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.43 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  27.78 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.99 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.24 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.37 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.55 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  32.68 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.8 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  32 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1280  cobalamin synthase  37.16 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  34.1 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.64 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.09 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  37.79 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.52 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1681  cobalamin synthase  38.46 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  38.46 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.3 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.74 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  32.58 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  32.8 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.39 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  30.63 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.03 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  32.8 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.25 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.37 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  33.85 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  30.92 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.92 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  29.43 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1240  cobalamin synthase  36.76 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436418  normal  0.920424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  29.43 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.23 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  32.31 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  29.63 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.43 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.11 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.85 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  28.67 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.33 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  28.68 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  33.56 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.36 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  28.93 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  34.24 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.32 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  34.24 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>