213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12236 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  100 
 
 		 249 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  59.43 
 
 		 243 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  61.07 
 
 		 243 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  60 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  60 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  60 
 
 		 248 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.75 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.76 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  51.53 
 
 		 237 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.19 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  42.31 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.19 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.32 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.9 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.09 
 
 		 278 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.08 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.1 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.66 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.67 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.33 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.38 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.2 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  31.2 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.99 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.8 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.68 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.45 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.28 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  31.56 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.96 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  28.4 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.73 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.62 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  28.4 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  31.58 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.2 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.44 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.86 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.94 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.02 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.02 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.15 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  29.6 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  30 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  30 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  30 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  29.6 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  29.75 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  28.99 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  26.12 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  28.1 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.4 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.98 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  26.02 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.51 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.6 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.86 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.39 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  30.71 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.27 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  31.28 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.07 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.4 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  45.61 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.69 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.4 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  28.17 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.53 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.75 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  30.58 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  28.99 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  27.62 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  26.8 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  27.95 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.54 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  30 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.16 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  35 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  37.93 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.5 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.48 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.56 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  32.54 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.49 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  28.57 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.69 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.29 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  28.33 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.43 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  29.08 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>