229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1357 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 237 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.85 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  51.74 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  50.57 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  53.89 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  45.24 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.54 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.75 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  50.21 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  50.21 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  50.21 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.33 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.3 
 
 		 323 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  48.7 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.53 
 
 		 259 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.54 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  45.26 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.93 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.47 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.11 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  52.35 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.96 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  32.64 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.18 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.44 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.75 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.95 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  34.44 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.11 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  34.45 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.87 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  34.87 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.87 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  44.39 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  34.45 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  35.91 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.99 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  32.92 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.98 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.89 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.76 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.98 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.27 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  35.64 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.12 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.27 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  35.15 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.06 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.13 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.09 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.5 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  37.61 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.59 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  25 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.17 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1698  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.92 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  35.06 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  31.54 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.59 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.79 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.51 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.99 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.99 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.83 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  32.58 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.25 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  32.08 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.34 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  30.3 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.08 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.72 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  34.16 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  31.43 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  34.27 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  29.6 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  33.96 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.45 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  31.69 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.56 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  34.76 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.34 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.18 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.67 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  30.04 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  36.32 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.98 
 
 		 282 aa  62  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.68 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  27 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.56 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>