166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0857 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 232 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  54.11 
 
 		 241 aa  243  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.97 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.73 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.54 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.26 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.26 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.26 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.26 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.78 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.26 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  29.52 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  29.52 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  29.52 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.82 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  29.52 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  29.82 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  29.82 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.78 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.5 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.85 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.11 
 
 		 262 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.59 
 
 		 250 aa  62  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.68 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.78 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.49 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.38 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  29.82 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.58 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  27.94 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.22 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.59 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.31 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.08 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.94 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.81 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.02 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1055  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.49 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.55 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.22 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.81 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.33 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.77 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.67 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.2 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.36 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.43 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  27.27 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  22.12 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.78 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.02 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.28 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.89 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  34.19 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.44 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  25.97 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  25.97 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  25.97 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.03 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.71 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  26.45 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  26.45 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.94 
 
 		 249 aa  52.4  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  28.24 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  20.48 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  22.87 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  22.8 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  21.72 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  31.13 
 
 		 261 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1973  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.46 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.9 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.88 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  26.32 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.71 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.09 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.64 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  25.42 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  22.87 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  22.87 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  27.71 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  22.87 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  22.87 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  22.87 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  22.87 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  22.87 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  24.51 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  23.38 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  21.52 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.94 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.75 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.59 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  22.04 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  27 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.09 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  27 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.78 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.84 
 
 		 269 aa  48.5  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>