151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1550 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 247 aa  481  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  59.48 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.21 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  50.63 
 
 		 246 aa  208  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.44 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.19 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.92 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.02 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.82 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.6 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.59 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.43 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  30.56 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.95 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.95 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.77 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.43 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.28 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.17 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.46 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  31 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.81 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.71 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.31 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.94 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.81 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.26 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.43 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.67 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  30.92 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.54 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  30.53 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.34 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.2 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.02 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.51 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.22 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.65 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  29.96 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.96 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  34.15 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.67 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.89 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  29.63 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.3 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  23.87 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.83 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  29.84 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  29.84 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  30.61 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.29 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  30.13 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.91 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  29.17 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.25 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.87 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  26.64 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.75 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.73 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  28.97 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  34.51 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.37 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.91 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.31 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.45 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.52 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.71 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.69 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.68 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  34.48 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  30.77 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  29.89 
 
 		 224 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  27.59 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.11 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  29.44 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  30.87 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.21 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.29 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  25.54 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.06 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.86 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.81 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.29 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.17 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  26.36 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.17 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1055  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.25 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.19 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.49 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.11 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.55 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>