131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0745 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 257 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  93.39 
 
 		 257 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  91.83 
 
 		 257 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  77.56 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  46.22 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.92 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.94 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.91 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.05 
 
 		 271 aa  85.1  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.26 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.8 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.82 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.38 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.62 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.06 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.06 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.97 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.41 
 
 		 275 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.58 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.91 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.12 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  26.98 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.68 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.68 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.91 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.73 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.43 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.66 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.27 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  26.48 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  25.82 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.91 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.08 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.45 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.38 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.34 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.53 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  28.35 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  27.24 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  27.24 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.24 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.1 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.86 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.31 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.24 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.06 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  27.1 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.11 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.27 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  33.05 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  27.1 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  27.1 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.1 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  27.1 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  27.1 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  25.2 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.79 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  25.68 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.64 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.12 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.57 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  26.47 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.38 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  27.75 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  25.58 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  27.13 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.81 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.03 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.94 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  32.14 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.21 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01926  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.15 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  27.47 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.9 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.51 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  34.83 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.78 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  27.76 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.76 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.64 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  28.07 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  22.45 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.38 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.93 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  25.59 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  23.19 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.83 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1894  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.577089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  26.51 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.91 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.17 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  22.14 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.03 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  24.81 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  26.6 
 
 		 249 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>