84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1370 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 
227 aa  442  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  85.19 
 
 
216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  59.07 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.1 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.37 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0633733 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.4 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.6 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.8 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.41 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.94 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.49 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.1 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.83 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  29 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  32.35 
 
 
247 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  30.67 
 
 
247 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  31.09 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  32.77 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  31.09 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  32.77 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.81 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.77 
 
 
247 aa  62  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  30.8 
 
 
240 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  26.12 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.02 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.2 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.2 
 
 
254 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32.35 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32.35 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32.35 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  32.35 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.35 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  29.92 
 
 
252 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  31.09 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  28.4 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.42 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.33 
 
 
253 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.31 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.36 
 
 
246 aa  55.1  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.91 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  27.2 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.89 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.16 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  25.61 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.79 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.17 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.88 
 
 
246 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.33 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  26.77 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.45 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.9 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.61 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  26.38 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.72 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 
248 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.65 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.34 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  33.49 
 
 
254 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.29 
 
 
253 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.77 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.85 
 
 
250 aa  45.4  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  25 
 
 
250 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.56 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.99 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.15 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.41 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.86 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.83 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.45 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2710  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.2 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.752805  normal  0.565232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  30 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  30.81 
 
 
259 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.75 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.59 
 
 
252 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  36.8 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.21 
 
 
248 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.63 
 
 
232 aa  41.6  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>