209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0238 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 245 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3406  hypothetical protein  81.74 
 
 		 234 aa  302  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286076  normal  0.20657 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2367  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  52.86 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.415535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.04 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.17 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.93 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.29 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.29 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.28 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.15 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.83 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  34.29 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  31.98 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  33.07 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.1 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  30.4 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  30.92 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  44.17 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  32.49 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  31.51 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  33.19 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.63 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.81 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  31.5 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  31.1 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  40.94 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  39.09 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.52 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.28 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  29.55 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.78 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  25.61 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  31.17 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.09 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  32.92 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.42 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  31.56 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  32 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.56 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.91 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  31.33 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  35.84 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.19 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.56 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  32.52 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  32.52 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  32.52 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.85 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  32.52 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  32.52 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  32.52 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  32.52 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.17 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.8 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  28 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  32.03 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.22 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  38.06 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.93 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.82 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  27.6 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  34.33 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.45 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.89 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.68 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.14 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.21 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  27.78 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  34.55 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.6 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.21 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.57 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.56 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.33 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  32 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  28.52 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  30.57 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.85 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.27 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  25 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01926  cobalamin synthase  36.17 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  30.57 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  34.33 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>