243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01926 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01926  cobalamin synthase  100 
 
 		 244 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  54.77 
 
 		 245 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  55.79 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  46.64 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  48.88 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  50.63 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  45.89 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  50 
 
 		 230 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  42.86 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.5 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1759  cobalamin synthase  50.68 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  40.08 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1280  cobalamin synthase  48.15 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.67 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.67 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33030  cobalamin synthase  51.9 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1681  cobalamin synthase  48.54 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  48.1 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.13 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.43 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1240  cobalamin synthase  46.64 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436418  normal  0.920424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  41 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.25 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1452  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.54 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.33 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  35.69 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.3 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.88 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  34.18 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.98 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.71 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.77 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.82 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  34.8 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  34.13 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.93 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  34.94 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.94 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  34.13 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  34.94 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.08 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  34.94 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  28.92 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.19 
 
 		 302 aa  85.5  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  32.95 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  33.85 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.3 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.76 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.41 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.26 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.82 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  34.54 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  34.54 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  34.54 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  34.54 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  34.26 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.47 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  31.89 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  33.05 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.31 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.38 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.68 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.79 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.77 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.11 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.81 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2816  cobalamin synthase  43.7 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0135582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.67 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.58 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  31.25 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.7 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.95 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.6 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.03 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.81 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.94 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.27 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.22 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.56 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.48 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.19 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.25 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  32.22 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.37 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  32.11 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>