248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2186 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  100 
 
 		 247 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  98.38 
 
 		 247 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  98.38 
 
 		 247 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  98.33 
 
 		 240 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  97.57 
 
 		 247 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  82.19 
 
 		 247 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  82.19 
 
 		 247 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  82.19 
 
 		 247 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  82.19 
 
 		 247 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  81.38 
 
 		 247 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  81.38 
 
 		 247 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  81.78 
 
 		 247 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  81.38 
 
 		 247 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  81.78 
 
 		 247 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  38.24 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  34.04 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.29 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.53 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.71 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  36.68 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.02 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.22 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  36.33 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  37.05 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  36 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.08 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.14 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  34.43 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.98 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.39 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.46 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  35.6 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.86 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  34.54 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  33.87 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.01 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  34.41 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  33.85 
 
 		 262 aa  101  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.34 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  36.33 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.82 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  33.86 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.2 
 
 		 269 aa  99  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.66 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.56 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.98 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.81 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.6 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.15 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.47 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  32.93 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  31.56 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  34.25 
 
 		 224 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  32.4 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.47 
 
 		 261 aa  92  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1698  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.23 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.98 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.84 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.21 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  31.47 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.68 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.68 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.01 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  32 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  32 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.32 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  34.43 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.23 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.73 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.82 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.91 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  32.02 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.43 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.01 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  35.17 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.04 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.85 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.45 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  35.47 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  35.78 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.2 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.13 
 
 		 272 aa  85.9  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>