244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0465 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  100 
 
 		 230 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  52.73 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  51.36 
 
 		 243 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  52.74 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  53.59 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  50.63 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1280  cobalamin synthase  53.24 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  54.17 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1681  cobalamin synthase  53.7 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  45.15 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1240  cobalamin synthase  50.45 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436418  normal  0.920424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  42.29 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1759  cobalamin synthase  48.87 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33030  cobalamin synthase  54.08 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114752  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01926  cobalamin synthase  51.08 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1452  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.35 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.93 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.13 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  37.34 
 
 		 247 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  37.34 
 
 		 247 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.34 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  38.02 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  35.29 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  37.6 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  37.6 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  37.6 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  37.6 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.7 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.33 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  36.1 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  34.33 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 		 251 aa  99  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  34.78 
 
 		 261 aa  98.2  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.76 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.62 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.35 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.24 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  34.76 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.48 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2816  cobalamin synthase  45.26 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0135582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.04 
 
 		 269 aa  89.4  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  34.33 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.03 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.56 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.34 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  32.35 
 
 		 250 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.44 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  37 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.35 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  40 
 
 		 252 aa  85.9  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.87 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.84 
 
 		 302 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.48 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  29.36 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  37.66 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.31 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.04 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.76 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  32.08 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.89 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.24 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.17 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.25 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  32.76 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  32.76 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  32.22 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.83 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  35.71 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  32.65 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.78 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  33.19 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.75 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.76 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.36 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  34.71 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  31.3 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.71 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.21 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  32.5 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  32.5 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  32.5 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.76 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.3 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  33.05 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>