250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2609 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 248 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.24 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.11 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  36.14 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.03 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  36.78 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  36.78 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.78 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.18 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  36.36 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  36.36 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.52 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  36.36 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.6 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  36.36 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  35.95 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.91 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  38.33 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.97 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.56 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.56 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  41.2 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  35.95 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  35.23 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  31.15 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  35.47 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.05 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  32.93 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  35.29 
 
 		 262 aa  101  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.98 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  39.59 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.93 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.71 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.66 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  35.15 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.74 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  34.03 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.6 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.44 
 
 		 265 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  38.36 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.68 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.35 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  36.56 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  36.36 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.14 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  38.98 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  40.91 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.26 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.45 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  31.78 
 
 		 248 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  35.05 
 
 		 224 aa  95.5  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  38.84 
 
 		 245 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  36.9 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  35.86 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.98 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.17 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.98 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  32.7 
 
 		 224 aa  92.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  38.26 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.73 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.07 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.92 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.03 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  31.76 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.24 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.2 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.89 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  39.47 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1681  cobalamin synthase  39.47 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  32.5 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.94 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  39.29 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.76 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.48 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.7 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.68 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.5 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.27 
 
 		 302 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1759  cobalamin synthase  39.73 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  36.63 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.4 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  33.15 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.92 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>