230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0111 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 240 aa  473  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.93 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.16 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  32.16 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.39 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.69 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  30.42 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.04 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.04 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.04 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.28 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  32.98 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.5 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  30.7 
 
 		 264 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.4 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.96 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.2 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  29.49 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  29.57 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  31.36 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.05 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.08 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  31.03 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  27.02 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.89 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.7 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.45 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.4 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  25.93 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.93 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  25.93 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  26.85 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  26.85 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  26.85 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  26.85 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  25.93 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  29.26 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  31.15 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1452  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.97 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  28.51 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.92 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3406  hypothetical protein  31.3 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286076  normal  0.20657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  26.99 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  26.99 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  26.99 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  30.57 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  26.99 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  25.7 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.12 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.87 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  26.99 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  30.88 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  33.91 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  31.19 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.92 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.98 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  33.02 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  29.91 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.75 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.05 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  29.32 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.2 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.51 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  26 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.76 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  26.34 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  26.34 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  26.97 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.91 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.38 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  28.52 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  30.85 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.51 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  25.7 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.09 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.7 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  26.4 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.07 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.27 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.28 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.96 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2367  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.84 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.415535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.85 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.92 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.91 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.73 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.82 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  27.16 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.61 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.03 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>