235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3403 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  100 
 
 
256 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  56.08 
 
 
254 aa  249  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  54.84 
 
 
264 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  57.37 
 
 
260 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  57.37 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  56.02 
 
 
252 aa  240  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  48.54 
 
 
251 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.41 
 
 
249 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.25 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  39.11 
 
 
254 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.71 
 
 
254 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.71 
 
 
254 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.06 
 
 
268 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.9 
 
 
254 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.57 
 
 
261 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.22 
 
 
252 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.44 
 
 
253 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.62 
 
 
246 aa  98.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.32 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.32 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  30.59 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.86 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.86 
 
 
260 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  30.86 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.47 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.16 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
247 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.92 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.61 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.26 
 
 
193 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  33.33 
 
 
247 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  33.33 
 
 
240 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  33.2 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  33.33 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  33.33 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.94 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.63 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  33.07 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1636  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.24 
 
 
193 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.94 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.15 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.66 
 
 
249 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.17 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  34.69 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.74 
 
 
277 aa  82  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.22 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.5 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  32.66 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.62 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.62 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.1 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.43 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.88 
 
 
250 aa  79  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.46 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  30 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  30.08 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  32.69 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  29.44 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  34.12 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  29.92 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.78 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.4 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.04 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  32.81 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.46 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  31.11 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  29.6 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.21 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.63 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  29.57 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.3 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.41 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.44 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.53 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.81 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  28.28 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.37 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.92 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  33.12 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.02 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2710  cobalamin-5'-phosphate synthase  47.13 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.752805  normal  0.565232 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.08 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  33.12 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.45 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.29 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>