238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1172 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 250 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  38.74 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  41.54 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.38 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.33 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0787  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.3 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00056745  normal  0.0562894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.09 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.04 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  41.39 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.78 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.78 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1894  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.2 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.577089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.09 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  35.09 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.09 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  35.53 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  35.09 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  36.29 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.77 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  35.53 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  35.53 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  35.53 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  35.53 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.74 
 
 		 269 aa  95.9  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  35.8 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.21 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.21 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  34.21 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  38.71 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  33.77 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.49 
 
 		 267 aa  92  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 		 257 aa  92  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  32.07 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  35.83 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  33.77 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.94 
 
 		 275 aa  89  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  33.7 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1090  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.86 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1055  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.17 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  34.41 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.27 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  46.34 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  34.77 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  31.75 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.38 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.08 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  33.02 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1566  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.19 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212563  normal  0.0205938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.2 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.27 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.76 
 
 		 280 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  33.66 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  32.55 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  35.09 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.56 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.38 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  34.15 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.6 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.6 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.55 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  38.17 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  38.17 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  38.17 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.92 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  45 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  31.71 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  34.63 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1340  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.11 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  39.33 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  39.33 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.07 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.38 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.73 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  39.33 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.25 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  39.33 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  39.33 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  31.95 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  35.87 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.65 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.39 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.36 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.33 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.05 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4381  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.52 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  35.1 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  35.1 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1973  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.94 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  34.51 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  32.52 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.71 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.58 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  34.38 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2427  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.51 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.01359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>