236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1894 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1894  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 262 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.577089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.27 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.93 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  40.15 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.08 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  39 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.71 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  34.9 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  35.71 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  40.71 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.77 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  35.1 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.12 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.04 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  35.42 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.15 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 		 269 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.59 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.19 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.9 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  36.23 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  34.62 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  37.5 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  38.78 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  35.77 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.97 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.8 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.46 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  36.92 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  36.4 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.7 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.09 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  37.7 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  37.7 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  37.7 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  37.7 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  37.7 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  37.7 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  37.7 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  37.16 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.62 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.44 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  37.34 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.78 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  36.93 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  36.1 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  36.1 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  36.1 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  36.93 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  36.93 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.23 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  36.63 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.67 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  36.82 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.73 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  36.18 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  36.18 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.91 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.15 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  37.97 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.93 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  29.41 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.85 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  35.95 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0787  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.18 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00056745  normal  0.0562894 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  34.3 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  35.68 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  34 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  33.99 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  35.52 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.64 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.18 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  38.98 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  31.43 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  33.46 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  34.11 
 
 		 224 aa  99  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.46 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1973  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.5 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.25 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  32.95 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.94 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.43 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.68 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32.92 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32.92 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4381  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.77 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.92 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32.92 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.27 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.33 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.08 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  32.08 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>