200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0703 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  100 
 
 
260 aa  520  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.23 
 
 
255 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.52 
 
 
257 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.4 
 
 
254 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  34.94 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  29.89 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  34.62 
 
 
261 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  34.04 
 
 
259 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  32.12 
 
 
262 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.86 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  30.63 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  30.63 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  30.63 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.08 
 
 
261 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  34.47 
 
 
250 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.12 
 
 
261 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  31.02 
 
 
262 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  30.66 
 
 
262 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  30.66 
 
 
262 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.86 
 
 
259 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  33.19 
 
 
258 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.74 
 
 
269 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  30.29 
 
 
262 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 
260 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  33.48 
 
 
224 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.1 
 
 
302 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  35.74 
 
 
259 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  33.19 
 
 
259 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.51 
 
 
258 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.21 
 
 
267 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  34.29 
 
 
261 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  31.05 
 
 
295 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.92 
 
 
257 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  32.05 
 
 
250 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  32.05 
 
 
250 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  31.62 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.65 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  32.79 
 
 
256 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  32.65 
 
 
256 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.97 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  35.34 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.13 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.18 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.07 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.18 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  30 
 
 
249 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  31.76 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  34.55 
 
 
224 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  30.17 
 
 
257 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.34 
 
 
280 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  30.13 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.53 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.69 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  34.21 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  36.32 
 
 
262 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  28.4 
 
 
250 aa  85.1  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32.52 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32.52 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  32.93 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.52 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.68 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32.52 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  32.93 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  34.46 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.46 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  34.46 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.18 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.78 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.23 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.71 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.44 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  32.98 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.84 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  32.51 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.58 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  30.63 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.32 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.25 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  32.52 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  32.52 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  32.52 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  32.52 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  32.52 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  32.52 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  32.52 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.97 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  31.89 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.35 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.66 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.6 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.97 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2567  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.26 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.87 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.16 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1566  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.88 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212563  normal  0.0205938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  29.61 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1894  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.49 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.577089  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.08 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>