221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1340 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1340  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 263 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  51.74 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  46.54 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  46.54 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.08 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1973  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.2 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  45.16 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.82 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4381  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.62 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  39.29 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  38.46 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  41.9 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  40.73 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.5 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.72 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.74 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  39.23 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  38.7 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.4 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.98 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  38.25 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  38.17 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  39.44 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  39.44 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.69 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  34.29 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  34.29 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1566  cobalamin 5'-phosphate synthase  45.9 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212563  normal  0.0205938 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  34.69 
 
 		 247 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  35.85 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.25 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  35.86 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  34.29 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  34.29 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  34.29 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  34.29 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.29 
 
 		 248 aa  95.9  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.49 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.43 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.98 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.73 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.25 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  34.73 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.25 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  39.11 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  39.04 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.86 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.45 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.52 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.71 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  38.65 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  38.65 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.67 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.41 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.46 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.45 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.07 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.6 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.96 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.01 
 
 		 248 aa  85.5  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  47.62 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1894  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.52 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.577089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  35.08 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  31.98 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  45.69 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.26 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  33.87 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  36.29 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.47 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.46 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.85 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.05 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  39.84 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.24 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  37.93 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.68 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.68 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.02 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  33.19 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.6 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  31.78 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  31.4 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  43.33 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  35.77 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.44 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1055  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.92 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  32.68 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.98 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.05 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.98 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.27 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.83 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.95 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>