227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0678 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 270 aa  517  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0657  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  98.52 
 
 		 270 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00645782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  59.35 
 
 		 280 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  69.7 
 
 		 270 aa  285  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  62.82 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  61.37 
 
 		 282 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  54.58 
 
 		 270 aa  241  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2567  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  58.69 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.4 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.15 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  44.36 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  42.69 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.35 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  41 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.23 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  40.86 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  41.11 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.13 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  36.84 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  41.31 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  41.13 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.25 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  39.26 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.7 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.85 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.23 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  39.46 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  40.3 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.81 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  40.6 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  40.73 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.64 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  37.74 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  37.74 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.05 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  37.74 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  42.35 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  37.74 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  37.8 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.91 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  36.58 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  40.62 
 
 		 224 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  33.97 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  36.58 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.67 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  35.36 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  35.36 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  35.36 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.69 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  36.54 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  36.54 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  36.54 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  36.54 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.55 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.64 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  36.54 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  39.38 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.4 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.06 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  35 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  36.15 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  34.21 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  39.15 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.05 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.13 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.56 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  38.49 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.51 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  37.45 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.64 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.11 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.02 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.42 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  37.94 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.72 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.32 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.43 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  32.55 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  37.7 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  37.7 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  34.87 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.01 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  32.95 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  32.95 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.85 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.23 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  32.95 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  35.94 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  35.94 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  35.94 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  35.94 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  35.94 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  35.94 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  35.94 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  27.34 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.77 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.46 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>