216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0631 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.93 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  39.3 
 
 		 258 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  42.91 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  41.2 
 
 		 250 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  40.07 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  41.33 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  41.6 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  41.6 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.41 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  40.52 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  40.52 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  41.33 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  39.29 
 
 		 258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  40.45 
 
 		 259 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  40.77 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.46 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  41.02 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  40.74 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.87 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  39.93 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  40.66 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  41.39 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.15 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  38.72 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.96 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  39.41 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  41.7 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.85 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.92 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  38.34 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.06 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  39.1 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  38.82 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.26 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  39.47 
 
 		 262 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  39.47 
 
 		 262 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  39.47 
 
 		 262 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  39.55 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  38.93 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  38.93 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  38.93 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  38.93 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.69 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.63 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  37.17 
 
 		 262 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.46 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.81 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.06 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.33 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.5 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  36.12 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.89 
 
 		 270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  35.74 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  35.74 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.31 
 
 		 282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  35.74 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  35.74 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  35.74 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  35.74 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  35.74 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0657  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.07 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00645782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.59 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.08 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.83 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.63 
 
 		 258 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.67 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  35.04 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.62 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.73 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.07 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2567  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.02 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.95 
 
 		 253 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.42 
 
 		 239 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  31.54 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  31.56 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  31.62 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.05 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.9 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.98 
 
 		 273 aa  89.7  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.36 
 
 		 275 aa  89  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  30.48 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 		 249 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.23 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.88 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  32.71 
 
 		 256 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.27 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.18 
 
 		 265 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  46.79 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  29.18 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.05 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.8 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  31.08 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  31.91 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.11 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.11 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.11 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.03 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  30.68 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>