228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3135 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 239 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  46.94 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2710  cobalamin-5'-phosphate synthase  51.23 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.752805  normal  0.565232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.6 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.87 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.44 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.31 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.42 
 
 		 302 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.13 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.33 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  36.44 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3406  hypothetical protein  35.22 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286076  normal  0.20657 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.88 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  27.69 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  30.96 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  34.16 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.19 
 
 		 267 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.6 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.51 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01926  cobalamin synthase  33.9 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  33.33 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  31.93 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.71 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.71 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.17 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  29.37 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.39 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  30.54 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  30.52 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  34.21 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.82 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  32.95 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.29 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.94 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.29 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1452  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  34.25 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.51 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  30.67 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.03 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  30.13 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.18 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.79 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  29.75 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  31.39 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.88 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  30.21 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  30.21 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  30.96 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.68 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.68 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.68 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.92 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.74 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.11 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  27.13 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  32.51 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  31.38 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.76 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  29.79 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  28.34 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  32.41 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  40.17 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.68 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.03 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  27.7 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  28.28 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.94 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.68 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  30.94 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.68 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  32.78 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.68 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.68 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.68 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  30.56 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  29.67 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.04 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.27 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  32.78 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  34.01 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  34.01 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  29.27 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.03 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  34.01 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  34.01 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  34.01 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  34.01 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  34.01 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  27.54 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.86 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.05 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.06 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>