247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3083 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 251 aa  477  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  53.81 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  53.19 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.41 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  50.61 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  52.48 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.75 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.62 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.5 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  37.1 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.69 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.69 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  32.22 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.02 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.13 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.42 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.7 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  34.98 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.5 
 
 		 242 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.07 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  34.57 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.03 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  34.16 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  32.53 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  32.53 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  32.53 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  35.37 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  35.12 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.96 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.96 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  34.19 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.35 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  40.87 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.25 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  36.18 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  36.18 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  36.18 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  34.94 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  36.18 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.21 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  35.77 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  34.98 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.98 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  30.54 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  34.98 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.75 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  33.99 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  35.8 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.36 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.19 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.94 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  38.3 
 
 		 250 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  29.49 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  39.65 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.65 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  32.24 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.34 
 
 		 264 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  32.13 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.05 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.7 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.26 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.57 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  28.86 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.61 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.56 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.83 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  39.13 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.04 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.16 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.49 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  34.26 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.03 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.7 
 
 		 272 aa  85.1  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.32 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  32.4 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  36.36 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  35.57 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.64 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.34 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.95 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  31.45 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.16 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.73 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>