193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1582 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
241 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.67 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
271 aa  105  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.37 
 
 
280 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.1 
 
 
246 aa  99  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.89 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.92 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.21 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.4 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.81 
 
 
236 aa  95.1  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.82 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.16 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.85 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.92 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  31.6 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.22 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.216736 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.74 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.93 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.82 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.9 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.54 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.17 
 
 
248 aa  79  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.61 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.89 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.89 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.12 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.24 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.51 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.66 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.13 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.96 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.75 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.29 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.01 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.88 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.88 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.76 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.32 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.51 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  25.49 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.06 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.18 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  26.14 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.53 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.46 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  25.73 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  25.73 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.8 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.22 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  25.73 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  25.64 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.27 
 
 
246 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.86 
 
 
268 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  25.31 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.2 
 
 
254 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  25.79 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.38 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  25.79 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  25.79 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  25.79 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1055  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.58 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  30.94 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.27 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.11 
 
 
280 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.63 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.29 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  25.4 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.25 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  25.4 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.4 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  28.99 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  25.4 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.51 
 
 
302 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.39 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.24 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  29.56 
 
 
295 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.45 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.27 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  28.69 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  28.51 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.19 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.02 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.57 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  28.51 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.84 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  28.51 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.88 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.83 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.9 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.23 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.03 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.27 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.27 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  28.76 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  24.9 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  30.58 
 
 
260 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>