42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0198 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 239 aa  467  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0633733 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  46.8 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.62 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.48 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.01 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.87 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.37 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.34 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.97 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.67 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.9 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.8 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.91 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.48 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.09 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.96 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.69 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.82 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.21 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.16 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.45 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  27.57 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.49 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.33 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.04 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.91 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.37 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  25.52 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.52 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  25.52 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  25.52 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  25.52 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  25.52 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  25.52 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  25.52 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.43 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  29 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  50 
 
 		 253 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.07 
 
 		 248 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.09 
 
 		 256 aa  42  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>