148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0733 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 236 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  62.21 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  52.08 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.42 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  57.08 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.09 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.15 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  32 
 
 		 280 aa  99  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.86 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.96 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.63 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.86 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.72 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.02 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.98 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.6 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0633733 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.86 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.64 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.16 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.16 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.9 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.97 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.8 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.86 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.78 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  27.66 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.31 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  27.66 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.66 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.12 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  27.62 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.92 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.76 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.03 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  27.62 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  27.62 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  27.62 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  27.62 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.49 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  23.97 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.2 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.39 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  26.77 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.74 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.02 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.38 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.9 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.65 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.28 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  26.83 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.07 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.76 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.77 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.77 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.18 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  32.11 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  32.23 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.17 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  30.96 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  32.23 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.58 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  32.11 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.58 
 
 		 277 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.66 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  31.4 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  27.85 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.54 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.85 
 
 		 280 aa  52  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.38 
 
 		 258 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  28.57 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.04 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.49 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  27.69 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.16 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.11 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  31.54 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.61 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.46 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.89 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  31.36 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.39 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.34 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.69 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.74 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.97 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.55 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.64 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.52 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.22 
 
 		 260 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  35.71 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  29.3 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3406  hypothetical protein  30.42 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286076  normal  0.20657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.08 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  38.32 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>