151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1443 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 
246 aa  490  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  49.8 
 
 
243 aa  223  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.42 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  52.42 
 
 
247 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  45.96 
 
 
236 aa  155  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.98 
 
 
271 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.56 
 
 
280 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.36 
 
 
246 aa  102  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.1 
 
 
241 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.15 
 
 
257 aa  91.7  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.6 
 
 
257 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.77 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.03 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.82 
 
 
257 aa  85.5  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.92 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.49 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.4 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.72 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  28.8 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.13 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.67 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.45 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.8 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.28 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.61 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.97 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.24 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.2 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.85 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.47 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.06 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.06 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.28 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.39 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.64 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.98 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.1 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  27.69 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.88 
 
 
227 aa  62  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.27 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  27.73 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.02 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.23 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1636  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.44 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  27.92 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.75 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.29 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.4 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.79 
 
 
262 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.27 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.17 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.92 
 
 
248 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.95 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  29.6 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  29.6 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  29.6 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  29.6 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  29.2 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.2 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.07 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  29.2 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.96 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  27.49 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  28.4 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  29.77 
 
 
259 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.45 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.38 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.28 
 
 
270 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.65 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.83 
 
 
193 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  36.67 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  26.01 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  26.98 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.17 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  28.37 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  28.37 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  29.6 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  28.46 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  28.76 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.91 
 
 
278 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  28.46 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  28.46 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.91 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.35 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  28.5 
 
 
258 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.32 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  28.17 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  28.74 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.56 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  26.91 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  28.5 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.23 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  26.11 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  27.5 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  30.12 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  28.35 
 
 
260 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.34 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.72 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>