131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0143 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 253 aa  464  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  53.6 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  52.19 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.26 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.39 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.78 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.42 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.43 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.65 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.37 
 
 		 246 aa  88.6  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.67 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.27 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.69 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.34 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.1 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.22 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.28 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.28 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.48 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.17 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.69 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.62 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.28 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.89 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  32.81 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.88 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  32.42 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.86 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.6 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.61 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.08 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.86 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.77 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.43 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.77 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.08 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.32 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  29.2 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.71 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  30.98 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  29.2 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  28.8 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  32 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  29.73 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.38 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.38 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.38 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.38 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  29.27 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.28 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.68 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.92 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.23 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.02 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  28.8 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.8 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.08 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.75 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  29.92 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.18 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.63 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.16 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.23 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.03 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.77 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  29.18 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.32 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.95 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.36 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  29.67 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.08 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  29.53 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  30 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.09 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.56 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.89 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.78 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  31.35 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  30.04 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  28.84 
 
 		 224 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.95 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.87 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.82 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.39 
 
 		 241 aa  48.9  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.24 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  27.14 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  31.6 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.62 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.4 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.22 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  40.59 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.86 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.25 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  28.06 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  29.89 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  30.2 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  28.35 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>