180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0233 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 257 aa  473  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  51.36 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.05 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  51.37 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.26 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.35 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.78 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.35 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.3 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.19 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.75 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.67 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.74 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.79 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32.79 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32.79 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32.79 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  32.66 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  32.66 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.6 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  32.11 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  31.6 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.89 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.38 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  31.62 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.74 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.33 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.1 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.2 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.66 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.44 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  30.5 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.34 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.42 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.06 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.98 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.84 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.84 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.68 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  30.52 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.46 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.02 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.04 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.71 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.09 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.78 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  29.76 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  29.76 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  31.2 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.71 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.17 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  30.23 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  31.32 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.8 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  30.55 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.68 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.07 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.9 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.08 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  29.37 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.95 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  29.64 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.54 
 
 		 302 aa  62  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  31.3 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.46 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  29.84 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.51 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.27 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  25.82 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  30.65 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.66 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.36 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  33.86 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.81 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.77 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  30.3 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.39 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  28.03 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  28.57 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.97 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.1 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.31 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.17 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  29.2 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  35.9 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.86 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  28.74 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.88 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  27.93 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>