136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2496 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 246 aa  464  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  56.05 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  51.56 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  56.45 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  52 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.06 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.62 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.98 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.27 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.57 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.47 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.95 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.06 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.09 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.23 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.97 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.02 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.92 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.48 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.31 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.79 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.37 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.74 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.9 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.74 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.74 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.74 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.45 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.61 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.6 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.4 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  30.71 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.4 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  32.68 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.69 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.34 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.67 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  27.43 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.38 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.3 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.49 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.62 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  31.52 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.8 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.02 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.74 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  24.69 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.02 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.16 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.39 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  26.03 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.59 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  32.5 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.47 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.89 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.38 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.94 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.74 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.36 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.33 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  31.56 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  29.34 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.8 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.87 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.58 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.75 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  25.41 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  31.13 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.29 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.86 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.27 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0657  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.95 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00645782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.57 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.51 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  30.42 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.14 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.45 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.87 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1392  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.61 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.69 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.27 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.03 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.03 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.52 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.97 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  38.58 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>