236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1110 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 251 aa  487  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  98.41 
 
 		 251 aa  480  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  34.02 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.54 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.9 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.19 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.75 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.47 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.03 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.2 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.13 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.28 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.16 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.17 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.17 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.44 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  33.82 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.04 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.84 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.57 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.42 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.26 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.82 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  21.76 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  24.7 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.75 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  29.27 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.2 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.74 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  28.63 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.67 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.99 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.94 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.11 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.59 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.41 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.75 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  25.31 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.41 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  25.98 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.53 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  29.55 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  30.71 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.35 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.58 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  35.34 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.76 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.4 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.46 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.15 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.92 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.38 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  23.81 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.42 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  27.43 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.36 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  27.43 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  27.43 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  32.5 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.79 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  23.72 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  27.35 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.17 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.35 
 
 		 233 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  25.34 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  26.58 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.16 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.89 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  27 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  27.57 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.57 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  26.53 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  33.64 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  27.57 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  27.57 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  28.91 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  30.58 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  23.92 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.31 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.96 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.53 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.26 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.05 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.11 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  24.6 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.31 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.58 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.83 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  30.53 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.48 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  27.01 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>