247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0173 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  80.83 
 
 		 268 aa  397  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  58.4 
 
 		 251 aa  271  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  49.13 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.95 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.2 
 
 		 249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.95 
 
 		 254 aa  132  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.95 
 
 		 254 aa  132  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  35.12 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  36.68 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  39.08 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.08 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  39.08 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  39.08 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  39.08 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  39.08 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  39.08 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.77 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  39.08 
 
 		 247 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  38.66 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.84 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  38.66 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  38.66 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  38.66 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.96 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  32.03 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  37.82 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  31.05 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  38.66 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.16 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.75 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.02 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.21 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.84 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.48 
 
 		 251 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.76 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.08 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.11 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.96 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.16 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.8 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.4 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.22 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  32.79 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.77 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  36.68 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  32.38 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  33.75 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  32.93 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.44 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.45 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.71 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.22 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.46 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.48 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  37.18 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.6 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  31.5 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  31.84 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.33 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  29.37 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.4 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.4 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  34.02 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.74 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  35.94 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  32.95 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  32.68 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.78 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.85 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.74 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  32.27 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.92 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.16 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.78 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  30.88 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.25 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.52 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.04 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.13 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  32.14 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.59 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.23 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.07 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.5 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.8 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  34.05 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.8 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.93 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  27.57 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.46 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>