251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1680 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 246 aa  479  1e-134  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.02 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.64 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  35.42 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.22 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.92 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  35 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  35 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.72 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.02 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.85 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.08 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.39 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.28 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.51 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  36.63 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.59 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  36.63 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  35.59 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.84 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  37.04 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  37.04 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  37.04 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  37.04 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  37.76 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  36.67 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  36.67 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  37.34 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  37.86 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.34 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.73 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  30.56 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.22 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.71 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.74 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  35.57 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.64 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  32.51 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.03 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.97 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.07 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.08 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  36.63 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.92 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  39.15 
 
 		 250 aa  85.5  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.16 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.86 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.51 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  35.95 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  31.23 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.57 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.91 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.05 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.68 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  31.38 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  31.22 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  29.03 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.32 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.49 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.08 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  31.8 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.99 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  35.26 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  31.98 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.5 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  35.39 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.71 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.89 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.73 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.74 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.96 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.61 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.93 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.31 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.59 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.21 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  36.21 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  30.35 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  34.98 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.05 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.46 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  29.88 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.56 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.85 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  29.07 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.94 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>