252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1856 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  100 
 
 		 250 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  49.78 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  48.67 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  51.25 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  47.7 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  51.67 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1681  cobalamin synthase  48.21 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1280  cobalamin synthase  47.32 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  48.21 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1452  cobalamin 5'-phosphate synthase  49.16 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1240  cobalamin synthase  48 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436418  normal  0.920424 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  44.26 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1759  cobalamin synthase  49.1 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.85 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.85 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  37.45 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33030  cobalamin synthase  47.08 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114752  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.76 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  43.36 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01926  cobalamin synthase  46.61 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.14 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  37.8 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.8 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.18 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  37.8 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.02 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  37.3 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  36.48 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  36.48 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  36.48 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  36.48 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  37.34 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  37.34 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  37.34 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.49 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  36.93 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.32 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.63 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.71 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2816  cobalamin synthase  47.52 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0135582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.92 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  36.33 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.29 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.7 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  38.98 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.69 
 
 		 246 aa  98.6  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  34.02 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  35.25 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.21 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  36.25 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.13 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  30.74 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.6 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.4 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.69 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.04 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  29.25 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.55 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.16 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.62 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.66 
 
 		 275 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.71 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.44 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.51 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.43 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.51 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  36.18 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.71 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  35.46 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.9 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.3 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.96 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.08 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.97 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  34.44 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  34.65 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.06 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  32.38 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.13 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.77 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.59 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.03 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.64 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  33.46 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  34.55 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.85 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  34.85 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  34.85 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  34.85 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.78 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.59 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  36 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  32.8 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  34.71 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>