212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1196 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  100 
 
 
260 aa  510  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  98.08 
 
 
260 aa  504  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  64.34 
 
 
264 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  61.76 
 
 
252 aa  285  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  55.79 
 
 
255 aa  258  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  57.68 
 
 
254 aa  248  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  56.97 
 
 
256 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  52.44 
 
 
251 aa  205  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.98 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.21 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.83 
 
 
268 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.69 
 
 
252 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.47 
 
 
251 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  35.5 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.25 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.86 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.14 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.14 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.66 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.89 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.16 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 
240 aa  90.1  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1636  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.62 
 
 
193 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.9 
 
 
193 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.23 
 
 
248 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.94 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.8 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.37 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.35 
 
 
246 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.86 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.52 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.15 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.68 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.27 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.19 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.86 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.36 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  32.66 
 
 
240 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  33.33 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  32.66 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  32.66 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.86 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  31.17 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.52 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  31.05 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.05 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.65 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.65 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.65 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.03 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.79 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  31.05 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.65 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.44 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.43 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  31.05 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.75 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  32.92 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  31.15 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.26 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  29.57 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.64 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  28.85 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.67 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.07 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.75 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.21 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  34.38 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  30.27 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.24 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  28.12 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2710  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.7 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.752805  normal  0.565232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.2 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.37 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  33.74 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.45 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.07 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  28.41 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.27 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.75 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  29.26 
 
 
224 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  32.02 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  34.17 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  29.28 
 
 
224 aa  62  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  28.05 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.67 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.6 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.29 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.43 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.24 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.7 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.89 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.57 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1566  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.16 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212563  normal  0.0205938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>