211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02971 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 
268 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.53 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  45.45 
 
 
256 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  46.28 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.35 
 
 
251 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.42 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.93 
 
 
233 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1636  cobalamin-5'-phosphate synthase  46.32 
 
 
193 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  36.82 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.22 
 
 
193 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  35.77 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.6 
 
 
255 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02931  cobalamin-5-phosphate synthase  43.71 
 
 
170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  35.83 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  35.83 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  32.79 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  32.24 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  35.32 
 
 
251 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.66 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.17 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 
251 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.2 
 
 
254 aa  92  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.2 
 
 
254 aa  92  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  31.44 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.75 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.17 
 
 
270 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.4 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.96 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.97 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  29.55 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.55 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  29.55 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  31.33 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  30.9 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  31.03 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  30.9 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  30.9 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.23 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  31.77 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  28.7 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  28.16 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  28.7 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.09 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  28.7 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  28.7 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  28.7 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.75 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  26.92 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.99 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  29.88 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.92 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  26.98 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.14 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.53 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.03 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.73 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  29.26 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  28.25 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.27 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  31.02 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.2 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.39 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  27.08 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.71 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.34 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.52 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.08 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.43 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.78 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  26.69 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.91 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.56 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.94 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.3 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.97 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  24.9 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.37 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.79 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  29.47 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.05 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.87 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  36.84 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  27.81 
 
 
258 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.48 
 
 
250 aa  62.4  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.05 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.28 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  26.5 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.34 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  27.88 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  27.15 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.08 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.08 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  25.38 
 
 
262 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.02 
 
 
267 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.9 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.83 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.47 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>