228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0941 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
272 aa  531  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  34.55 
 
 
248 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  30.04 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.11 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  33.72 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  32.68 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.68 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32.68 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32.68 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32.68 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.3 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  32.3 
 
 
247 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  32.3 
 
 
247 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.52 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.19 
 
 
251 aa  92.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  32.51 
 
 
250 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  31.91 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  31.13 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  30.74 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  31.13 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  32.44 
 
 
247 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  30.74 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.48 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.82 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.03 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.15 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.95 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.78 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.9 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  28.57 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.22 
 
 
254 aa  82  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.91 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  27.34 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  28.94 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.89 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.1 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.1 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.46 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.54 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  29.06 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.72 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.36 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.48 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.04 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  31.56 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.11 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.49 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.1 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  27.17 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.55 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  27.38 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.31 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  29.28 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.37 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.21 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.32 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.63 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  27.73 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  27.73 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.13 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  35.51 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  36.09 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.62 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.38 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.22 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.52 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.51 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  25.49 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.79 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.06 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.1 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.15 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  29.91 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.83 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  30.04 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  29.85 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.24 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  29.41 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.2 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.47 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.3 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  26.45 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.77 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.78 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.3 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.74 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  26.14 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  28.31 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  31.21 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  25.86 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  26.91 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  35.77 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  35.77 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  35.77 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.69 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  35.77 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  35.77 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  35.77 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>