250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4584 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 268 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  80.83 
 
 		 268 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  59.49 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  54.55 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.86 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.4 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.97 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.97 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  37.13 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  34.33 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.64 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  36.32 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  34.63 
 
 		 250 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.33 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.65 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.16 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.72 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  38.68 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  38.27 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  38.68 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  38.68 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.91 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.46 
 
 		 246 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  37.86 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.24 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.62 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  37.45 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  37.45 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  37.45 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  37.45 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  37.45 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  37.45 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  37.45 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.28 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.21 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.71 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.89 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  34 
 
 		 258 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  37.04 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.4 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.55 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.04 
 
 		 248 aa  99  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.27 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  34.44 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  37.5 
 
 		 250 aa  92.8  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 		 252 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.32 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.71 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  40 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  32.79 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  33.96 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.17 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.05 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  32.29 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  31.87 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.6 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.32 
 
 		 255 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  33.85 
 
 		 251 aa  85.9  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  33.07 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.31 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.8 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.54 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  35.19 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.5 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.61 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.65 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.65 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  30.2 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.74 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  32.44 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.06 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.55 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.81 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  32.66 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.69 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1698  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.59 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  33.97 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.05 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.06 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  29.55 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  33.59 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  32.91 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  29.37 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.63 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  30.95 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.27 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.49 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.62 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  31.95 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.59 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.96 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.01 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.04 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  31.51 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  29.25 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>