174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1698 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1698  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  34 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  34 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.6 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  32.93 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  32.64 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  32.23 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  32.23 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  32.23 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  32.23 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.37 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.18 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  29.03 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  29.37 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.05 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.06 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.8 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.74 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  27.54 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  29.8 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  29.8 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  29.8 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.19 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  29.39 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  41.58 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  29.39 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  29.39 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  29.39 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  28.93 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.05 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  27.98 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.89 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  29.49 
 
 		 224 aa  72  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.25 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  29.34 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.58 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.61 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.51 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.59 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.89 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  29.39 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  29.83 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.93 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.08 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  27.6 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  33.96 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  27.6 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  27.6 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.49 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  29.28 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.41 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  32.08 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  29.23 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.27 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  29.11 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.15 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.38 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.23 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.53 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.19 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  26.4 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  31.13 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.49 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  31.93 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.7 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.74 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.66 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.76 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.9 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.51 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.55 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.72 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.73 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.61 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.85 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.44 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.44 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.37 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  26.14 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  30.54 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.17 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  30 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.53 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.82 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.76 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  26.79 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>