209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1718 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 
250 aa  472  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  33.33 
 
 
248 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.26 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.77 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  31.17 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.25 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.25 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.25 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.25 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.74 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.74 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.74 
 
 
247 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  32.08 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  32.08 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  32.08 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  31.67 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.25 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  31.14 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  31.25 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  30.54 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.17 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.32 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.42 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.4 
 
 
260 aa  72  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.81 
 
 
249 aa  72  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.88 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.22 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  27.72 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.17 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.91 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  28.44 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.38 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.81 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.89 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  28.69 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2247  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.75 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.19 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.96 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.04 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.9 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.24 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.53 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  34.2 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.5 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  32.28 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.92 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  27.8 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.89 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  29.18 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.06 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.63 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  30.69 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.72 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.62 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.61 
 
 
277 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.34 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  30.92 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  30.77 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  30.77 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  29.31 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  28.82 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  29.31 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.25 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  33.69 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  29 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  30.81 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.73 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.06 
 
 
259 aa  58.9  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.81 
 
 
270 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  30.68 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  28.76 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.39 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  29.39 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  37.07 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.13 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.49 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.53 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.98 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1698  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.53 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  37.07 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  37.07 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  37.07 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  37.07 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.6 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  37.07 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  37.07 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  37.07 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.53 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.13 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.44 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.53 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.78 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.77 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  30.58 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  37.6 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>