195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2247 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2247  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 241 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.51 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1392  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.61 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.42 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2258  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.43 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147044  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.75 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.76 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.18 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.85 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.88 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.9 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.36 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  30.15 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.16 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.84 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.14 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  32.32 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.47 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.5 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.86 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.77 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  38.98 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.98 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.78 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.6 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.55 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.24 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.2 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  31.01 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  38 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.53 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.02 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.48 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.79 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.43 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.04 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.16 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  27.48 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.25 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.15 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.5 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.58 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.07 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.83 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.15 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.86 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.14 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1566  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.68 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212563  normal  0.0205938 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  30.43 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.59 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.78 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.09 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.78 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  35.65 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  28.29 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.78 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  27.98 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.81 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.09 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.12 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.88 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  36.52 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.38 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  34.5 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.21 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  34.04 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.56 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  35.29 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.93 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.78 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.77 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.78 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.78 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.78 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.78 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  24.84 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.03 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.37 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.27 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  30.91 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.67 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.67 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.54 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  33.62 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.26 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.3 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  32.77 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  33.78 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  33.62 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  34.6 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  33.62 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1894  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.64 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.577089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.63 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>