173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1368 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 241 aa  467  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  54.5 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.33 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.72 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  28 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  29.51 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  29.51 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  29.51 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  29.51 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  28.81 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  25.49 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.14 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  24.7 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.25 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  29.1 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.4 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.69 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.41 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  29.1 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  30.04 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  28.97 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.77 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.71 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.63 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.71 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  28.11 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.94 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.21 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.9 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  29.1 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  27.83 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.57 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.86 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.95 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.11 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  25.65 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.65 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.03 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.07 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.03 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  27.14 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.14 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  28.14 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  28.14 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  28.14 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.92 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  24.6 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.25 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.24 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.8 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  25 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.02 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.08 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  26.18 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.57 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.71 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0787  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.4 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00056745  normal  0.0562894 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.35 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.35 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  24.8 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.76 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.26 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.1 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1973  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.16 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.46 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.71 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.07 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.7 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3406  hypothetical protein  27.97 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286076  normal  0.20657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.65 
 
 		 268 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.54 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.1 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.25 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.67 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.5 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.84 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  26.11 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.39 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.42 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.91 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  23.95 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  23.62 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.62 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1055  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.8 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  25.98 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.42 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.43 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.08 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.84 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  22.75 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>