218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  100 
 
 		 271 aa  491  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  55.24 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.82 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.53 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  52.24 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.52 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.02 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.53 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.92 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.1 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  42.86 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.98 
 
 		 252 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.85 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.4 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.56 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  39.02 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  37.1 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  37.1 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.32 
 
 		 229 aa  92.4  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  37.1 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  32.11 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.92 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  32.11 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.11 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  41.58 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  32.11 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.73 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  32.93 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  32.52 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  32.93 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  32.93 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  32.73 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.28 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  35.53 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.52 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.79 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.52 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.97 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.05 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.55 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.97 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.07 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.71 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.98 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.08 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.9 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  23.66 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  31.23 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.88 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.7 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.3 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.37 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.28 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.28 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  26.51 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.93 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.73 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.73 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.58 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  34.57 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.66 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  29.06 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.94 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.01 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.68 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  30.98 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.67 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.2 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.08 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  34.71 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.52 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  36.31 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.67 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.1 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  32.65 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  28.98 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.08 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1973  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.69 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  34.95 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.43 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  30 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.78 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.49 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.84 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.24 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  25.87 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.89 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.24 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  27.02 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0787  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.23 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00056745  normal  0.0562894 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  23.27 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  23.51 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  29.5 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>