223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0585 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 245 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.77 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.94 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  52.48 
 
 		 323 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.95 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  45.5 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  44.92 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  44.62 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.46 
 
 		 268 aa  92  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  41.84 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  41.84 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.05 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.44 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  41.42 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.89 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  45.25 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.51 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  35 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.76 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.8 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.46 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.9 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.96 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.22 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  32.41 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  26.84 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.59 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.14 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.48 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.48 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.44 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  31.4 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  31.4 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.89 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.87 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  31.4 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  31.4 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.87 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.87 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.42 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.97 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.79 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.77 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  36.45 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  32.79 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  31.19 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  51.35 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.82 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  28.1 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  48.08 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.05 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  35.37 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.51 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.55 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  31.98 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.04 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  27.54 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.52 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.33 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  35.25 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.07 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.54 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.22 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.48 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.36 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.2 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  31.35 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.07 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  47.47 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.86 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  34.83 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.76 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.96 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.95 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.64 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.91 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  34 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  30.45 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.88 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.4 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.47 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.35 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  35.81 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  51.92 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.03 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.8 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  36.52 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.05 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.9 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.32 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  42.31 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  29.44 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>