171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3572 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  100 
 
 		 243 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  73.97 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  65.73 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  65.32 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  65.32 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  61.07 
 
 		 249 aa  242  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.41 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  56.88 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.38 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.31 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.25 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  52.54 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.45 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.22 
 
 		 323 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  41.09 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.01 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.61 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.66 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.3 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.54 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.97 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  32.42 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.33 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.5 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  39.38 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.06 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.79 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  29.8 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.86 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.02 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.12 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  33.76 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  32.08 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.02 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  31 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.08 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.42 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.04 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.94 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.72 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.21 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.84 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  31.8 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.91 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  25.41 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.66 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.75 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  28.57 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.28 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  30.24 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  30.24 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  35 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  29.44 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  28.84 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  32.54 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.99 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  28.37 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.03 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.82 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  31.37 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.84 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.92 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.14 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  36.84 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.2 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  28.74 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.94 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  30.43 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  28.09 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.71 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.29 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1681  cobalamin synthase  36.42 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  30.43 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.3 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32.54 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32.54 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32.54 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.54 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.51 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.51 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.34 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.26 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 280 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  35 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  31.25 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.33 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1240  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436418  normal  0.920424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.77 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.67 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.87 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.42 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>