227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2941 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  100 
 
 		 243 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  73.97 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  59.43 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  66.8 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  66.8 
 
 		 248 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  66.8 
 
 		 248 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  55 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.2 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.41 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.02 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.83 
 
 		 257 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  51.11 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.2 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.97 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.5 
 
 		 278 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  39.13 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.24 
 
 		 323 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.7 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.71 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.29 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.5 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.08 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.46 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.89 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.65 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.69 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.64 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  28.46 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.31 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.31 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.83 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.31 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.2 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.86 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.47 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.31 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  35 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  28.03 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.05 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  36.96 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.93 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  31.4 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.78 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.31 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.31 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.24 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.31 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.31 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.2 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.12 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  28.97 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  30.38 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.92 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  31.1 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.05 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  30.59 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.49 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  31.1 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  30.31 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.98 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.34 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  31.84 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.89 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.18 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  29.36 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  29.34 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.8 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  30.38 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  30.74 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  30.25 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.51 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.88 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  29.53 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  32.71 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  32.89 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  29.46 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.56 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  31.15 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.6 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.67 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.66 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.77 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.1 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.1 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  28.51 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.1 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.18 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1392  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.15 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.16 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.34 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.79 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  30.56 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.21 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  36.59 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.1 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.24 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  31.2 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.83 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>